Основни дейности на териториалните дирекции:

• осъществява организацията и контролира заделянето, съхраняването, опресняването, отчитането и опазването на държавните резерви и военновременните запаси;
• анализира състоянието и прави предложения за подмяна на държавни резерви и военновременни запаси, съхранявани в собствените бази;
• организира и контролира деблокирането на държавни резерви и военновременни запаси съобразно разпорежданията на председателя на агенцията;
• организира и контролира дейностите по управление при кризи и отбранително-мобилизационната подготовка.